农业部主要负责初级农产品生产环节的监管。主要职能包括：

　　一、组织开展农产品质量安全风险评估，提出技术性贸易措施的建议。组织农产品质量安全技术研究推广、宣传培训。

　　二、参与制定农产品质量安全国家标准，组织制定农业行业标准，并会同有关部门组织实施。制定农业转基因生物安全评价标准和技术规范。

　　三、组织农产品质量安全的监督管理。组织农产品质量安全监测和监督抽查，组织对可能危及农产品质量安全的农业生产资料进行监督抽查。负责农产品质量安全状况预警分析和信息发布。指导建立农产品质量安全追溯体系。指导实施农产品包装标识和市场准入管理，等等。

　　四、依法实施符合安全标准的农产品认证和监督管理。包括对无公害农产品、绿色食品和有机农产品实施认证和质量监督，对农产品地理标志审批登记和监督管理。

　　五、指导农业检验检测体系建设和机构考核。

　　质检总局:监管生产加工和进出口活动

　　依据《食品安全法》及其实施条例，国家质检总局对食品生产加工活动和进出口活动进行监督管理。

　　国家质检总局主要负责组织实施国内食品生产许可、生产加工环节安全监管，组织实施对食品生产者的监督检查，组织建立食品生产者安全信用档案，发布食品安全日常监管信息，依法责令食品生产者实施召回；负责组织实施国内食品添加剂生产许可；负责进出口食品、食品添加剂和食品相关产品的检验检疫和监督管理，对可能存在风险或者发现严重食品安全问题的进口食品采取风险预警或者控制措施；负责向我国境内出口食品的出口商或者代理商备案工作、向我国境内出口食品的境外食品生产企业的注册工作，以及出口食品生产企业和出口食品原料种植、养殖场备案工作，收集、汇总进出口食品安全信息等。配合有关部门做好食品安全风险监测和评估等工作。

　　其下属机构国家认监委负责管理食品检验机构资质认定，与有关部门共同公布对食品检验复检机构名录。国家标准委负责食品安全国家标准编号。